Protein–RNA interactions for Protein: F8W8V4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W8V4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
F8W8V4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
F8W8V4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
F8W8V4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
F8W8V4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
F8W8V4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
F8W8V4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
F8W8V4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
F8W8V4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
F8W8V4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
F8W8V4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F8W8V4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
F8W8V4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
F8W8V4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
F8W8V4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F8W8V4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
F8W8V4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
F8W8V4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F8W8V4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F8W8V4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F8W8V4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
F8W8V4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
F8W8V4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
F8W8V4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
F8W8V4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
F8W8V4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
F8W8V4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
F8W8V4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
F8W8V4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
F8W8V4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
F8W8V4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
F8W8V4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
F8W8V4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
F8W8V4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
F8W8V4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
F8W8V4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
F8W8V4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
F8W8V4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
F8W8V4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
F8W8V4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
F8W8V4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
F8W8V4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
F8W8V4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
F8W8V4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
F8W8V4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
F8W8V4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
F8W8V4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
F8W8V4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
F8W8V4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
F8W8V4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
F8W8V4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
F8W8V4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
F8W8V4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
F8W8V4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
F8W8V4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
F8W8V4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
F8W8V4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
F8W8V4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
F8W8V4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
F8W8V4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
F8W8V4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
F8W8V4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
F8W8V4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
F8W8V4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
F8W8V4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
F8W8V4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
F8W8V4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
F8W8V4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
F8W8V4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
F8W8V4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
F8W8V4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
F8W8V4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
F8W8V4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8W8V4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8W8V4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8W8V4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8W8V4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8W8V4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8W8V4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8W8V4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8W8V4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8W8V4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8W8V4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F8W8V4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F8W8V4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
F8W8V4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F8W8V4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
F8W8V4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
F8W8V4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
F8W8V4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
F8W8V4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
F8W8V4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
F8W8V4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
F8W8V4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
F8W8V4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
F8W8V4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
F8W8V4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
F8W8V4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
F8W8V4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
F8W8V4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms