Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
F8VP50 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
F8VP50 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
F8VP50 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
F8VP50 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
F8VP50 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
F8VP50 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
F8VP50 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
F8VP50 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
F8VP50 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
F8VP50 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
F8VP50 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
F8VP50 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
F8VP50 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
F8VP50 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
F8VP50 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
F8VP50 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
F8VP50 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
F8VP50 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
F8VP50 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
F8VP50 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
F8VP50 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
F8VP50 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
F8VP50 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
F8VP50 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
F8VP50 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
F8VP50 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
F8VP50 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
F8VP50 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
F8VP50 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
F8VP50 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
F8VP50 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
F8VP50 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
F8VP50 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
F8VP50 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
F8VP50 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
F8VP50 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
F8VP50 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
F8VP50 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
F8VP50 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
F8VP50 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
F8VP50 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
F8VP50 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
F8VP50 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
F8VP50 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
F8VP50 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
F8VP50 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
F8VP50 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
F8VP50 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
F8VP50 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
F8VP50 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
F8VP50 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
F8VP50 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
F8VP50 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
F8VP50 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
F8VP50 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
F8VP50 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
F8VP50 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
F8VP50 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
F8VP50 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
F8VP50 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
F8VP50 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
F8VP50 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
F8VP50 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
F8VP50 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
F8VP50 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
F8VP50 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
F8VP50 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
F8VP50 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
F8VP50 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
F8VP50 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
F8VP50 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
F8VP50 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
F8VP50 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
F8VP50 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
F8VP50 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
F8VP50 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
F8VP50 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
F8VP50 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
F8VP50 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
F8VP50 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
F8VP50 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
F8VP50 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
F8VP50 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
F8VP50 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
F8VP50 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
F8VP50 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
F8VP50 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
F8VP50 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
F8VP50 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
F8VP50 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
F8VP50 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
F8VP50 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
F8VP50 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
F8VP50 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
F8VP50 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
F8VP50 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
F8VP50 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
F8VP50 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
F8VP50 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms