Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB6E9PJ23 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NPIPB6E9PJ23 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPB6E9PJ23 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms