Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRN3E7EW58 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN3E7EW58 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN3E7EW58 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN3E7EW58 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms