Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN25C9JDP6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN25C9JDP6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN25C9JDP6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms