Protein–RNA interactions for Protein: C9J4A7

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9J4A7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9J4A7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9J4A7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9J4A7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9J4A7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9J4A7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9J4A7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9J4A7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9J4A7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9J4A7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9J4A7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9J4A7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9J4A7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9J4A7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9J4A7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9J4A7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9J4A7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9J4A7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9J4A7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9J4A7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9J4A7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9J4A7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9J4A7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9J4A7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9J4A7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9J4A7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9J4A7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9J4A7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9J4A7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9J4A7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9J4A7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9J4A7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9J4A7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C9J4A7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9J4A7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9J4A7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9J4A7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9J4A7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9J4A7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9J4A7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9J4A7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9J4A7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C9J4A7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9J4A7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9J4A7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9J4A7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C9J4A7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9J4A7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9J4A7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9J4A7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9J4A7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9J4A7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9J4A7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9J4A7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9J4A7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9J4A7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9J4A7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9J4A7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9J4A7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9J4A7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9J4A7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9J4A7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9J4A7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9J4A7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9J4A7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9J4A7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9J4A7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9J4A7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9J4A7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9J4A7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9J4A7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9J4A7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9J4A7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9J4A7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9J4A7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9J4A7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9J4A7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9J4A7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9J4A7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9J4A7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9J4A7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9J4A7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C9J4A7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C9J4A7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9J4A7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9J4A7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9J4A7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C9J4A7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9J4A7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9J4A7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9J4A7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C9J4A7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C9J4A7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C9J4A7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9J4A7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9J4A7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9J4A7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9J4A7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9J4A7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C9J4A7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms