Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
B4DEV8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
B4DEV8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4DEV8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4DEV8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4DEV8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4DEV8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
B4DEV8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4DEV8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
B4DEV8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4DEV8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4DEV8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4DEV8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4DEV8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
B4DEV8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4DEV8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4DEV8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4DEV8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4DEV8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
B4DEV8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4DEV8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
B4DEV8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
B4DEV8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
B4DEV8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
B4DEV8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
B4DEV8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
B4DEV8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
B4DEV8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
B4DEV8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
B4DEV8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
B4DEV8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
B4DEV8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
B4DEV8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
B4DEV8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
B4DEV8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
B4DEV8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
B4DEV8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
B4DEV8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
B4DEV8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
B4DEV8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
B4DEV8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
B4DEV8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
B4DEV8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
B4DEV8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
B4DEV8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
B4DEV8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
B4DEV8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
B4DEV8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
B4DEV8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
B4DEV8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
B4DEV8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
B4DEV8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
B4DEV8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
B4DEV8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
B4DEV8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
B4DEV8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
B4DEV8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
B4DEV8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
B4DEV8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
B4DEV8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
B4DEV8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
B4DEV8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
B4DEV8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
B4DEV8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
B4DEV8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
B4DEV8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
B4DEV8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
B4DEV8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
B4DEV8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
B4DEV8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
B4DEV8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
B4DEV8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
B4DEV8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
B4DEV8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
B4DEV8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
B4DEV8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
B4DEV8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
B4DEV8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
B4DEV8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
B4DEV8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
B4DEV8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
B4DEV8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
B4DEV8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
B4DEV8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
B4DEV8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
B4DEV8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
B4DEV8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
B4DEV8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
B4DEV8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
B4DEV8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
B4DEV8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
B4DEV8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
B4DEV8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
B4DEV8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
B4DEV8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
B4DEV8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
B4DEV8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
B4DEV8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
B4DEV8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
B4DEV8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms