Protein–RNA interactions for Protein: B0FP48

UPK3BL1, Uroplakin-3b-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL1B0FP48 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UPK3BL1B0FP48 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPK3BL1B0FP48 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPK3BL1B0FP48 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPK3BL1B0FP48 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms