Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF1

SAC3D1, SAC3 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAC3D1A6NKF1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAC3D1A6NKF1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAC3D1A6NKF1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAC3D1A6NKF1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAC3D1A6NKF1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAC3D1A6NKF1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAC3D1A6NKF1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAC3D1A6NKF1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAC3D1A6NKF1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAC3D1A6NKF1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAC3D1A6NKF1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAC3D1A6NKF1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAC3D1A6NKF1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAC3D1A6NKF1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAC3D1A6NKF1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAC3D1A6NKF1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAC3D1A6NKF1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAC3D1A6NKF1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAC3D1A6NKF1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAC3D1A6NKF1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAC3D1A6NKF1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAC3D1A6NKF1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAC3D1A6NKF1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAC3D1A6NKF1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAC3D1A6NKF1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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