Protein–RNA interactions for Protein: A6NGU7

LINC01546, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01546, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01546A6NGU7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01546A6NGU7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01546A6NGU7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms