Protein–RNA interactions for Protein: A6NFE2

SMCO2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO2A6NFE2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMCO2A6NFE2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMCO2A6NFE2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms