Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
PRAMEF22A3QJZ6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PRAMEF22A3QJZ6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRAMEF22A3QJZ6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRAMEF22A3QJZ6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRAMEF22A3QJZ6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PRAMEF22A3QJZ6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PRAMEF22A3QJZ6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PRAMEF22A3QJZ6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRAMEF22A3QJZ6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRAMEF22A3QJZ6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PRAMEF22A3QJZ6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PRAMEF22A3QJZ6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PRAMEF22A3QJZ6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PRAMEF22A3QJZ6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PRAMEF22A3QJZ6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PRAMEF22A3QJZ6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
PRAMEF22A3QJZ6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PRAMEF22A3QJZ6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PRAMEF22A3QJZ6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PRAMEF22A3QJZ6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms