Protein–RNA interactions for Protein: A0AVI4

TMEM129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, humanhuman

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Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM129A0AVI4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM129A0AVI4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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TMEM129A0AVI4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM129A0AVI4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM129A0AVI4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM129A0AVI4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM129A0AVI4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM129A0AVI4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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TMEM129A0AVI4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM129A0AVI4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM129A0AVI4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM129A0AVI4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM129A0AVI4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM129A0AVI4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM129A0AVI4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM129A0AVI4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM129A0AVI4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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TMEM129A0AVI4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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TMEM129A0AVI4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM129A0AVI4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM129A0AVI4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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TMEM129A0AVI4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM129A0AVI4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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TMEM129A0AVI4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM129A0AVI4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM129A0AVI4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM129A0AVI4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM129A0AVI4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM129A0AVI4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM129A0AVI4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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TMEM129A0AVI4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM129A0AVI4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM129A0AVI4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM129A0AVI4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM129A0AVI4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM129A0AVI4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM129A0AVI4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM129A0AVI4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM129A0AVI4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM129A0AVI4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM129A0AVI4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM129A0AVI4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM129A0AVI4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM129A0AVI4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM129A0AVI4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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