Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVM2

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVM2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1B0GVM2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1B0GVM2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1B0GVM2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1B0GVM2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1B0GVM2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1B0GVM2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1B0GVM2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1B0GVM2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1B0GVM2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A1B0GVM2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A1B0GVM2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1B0GVM2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1B0GVM2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1B0GVM2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1B0GVM2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1B0GVM2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
A0A1B0GVM2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A1B0GVM2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms