Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms