Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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