Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms