Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms