Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMILIN3Q9NT22 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms