Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MIXL1Q9H2W2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms