Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms