Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms