Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF559Q9BR84 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms