Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL2Q9BQD1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms