Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NXPE2Q96DL1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NXPE2Q96DL1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms