Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NXNL1Q96CM4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms