Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms