Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF248Q8NDW4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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