Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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LINC00518Q8N0U6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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LINC00518Q8N0U6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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LINC00518Q8N0U6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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LINC00518Q8N0U6 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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LINC00518Q8N0U6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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LINC00518Q8N0U6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00518Q8N0U6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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LINC00518Q8N0U6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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LINC00518Q8N0U6 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00518Q8N0U6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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LINC00518Q8N0U6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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LINC00518Q8N0U6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00518Q8N0U6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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