Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q6P435 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q6P435 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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