Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED27Q6P2C8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms