Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms