Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMA3Q16787 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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