Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECM1Q16610 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECM1Q16610 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECM1Q16610 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECM1Q16610 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECM1Q16610 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECM1Q16610 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECM1Q16610 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECM1Q16610 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECM1Q16610 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECM1Q16610 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECM1Q16610 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECM1Q16610 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECM1Q16610 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECM1Q16610 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ECM1Q16610 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECM1Q16610 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECM1Q16610 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECM1Q16610 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ECM1Q16610 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
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