Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXNQ16595 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXNQ16595 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXNQ16595 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXNQ16595 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXNQ16595 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXNQ16595 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXNQ16595 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXNQ16595 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXNQ16595 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXNQ16595 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXNQ16595 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXNQ16595 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXNQ16595 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXNQ16595 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXNQ16595 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXNQ16595 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXNQ16595 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXNQ16595 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXNQ16595 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXNQ16595 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXNQ16595 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXNQ16595 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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FXNQ16595 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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FXNQ16595 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXNQ16595 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXNQ16595 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXNQ16595 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXNQ16595 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXNQ16595 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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FXNQ16595 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXNQ16595 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXNQ16595 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXNQ16595 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXNQ16595 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXNQ16595 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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