Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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