Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IHHQ14623 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IHHQ14623 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IHHQ14623 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IHHQ14623 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IHHQ14623 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IHHQ14623 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IHHQ14623 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IHHQ14623 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IHHQ14623 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IHHQ14623 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IHHQ14623 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IHHQ14623 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IHHQ14623 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IHHQ14623 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms