Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms