Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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CAPSQ13938 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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CAPSQ13938 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPSQ13938 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
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