Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
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