Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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