Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FOXF1Q12946 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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