Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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