Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms