Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms