Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOMO3P69849 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms