Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR4P51571 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSR4P51571 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSR4P51571 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSR4P51571 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSR4P51571 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSR4P51571 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSR4P51571 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSR4P51571 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSR4P51571 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSR4P51571 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSR4P51571 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSR4P51571 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSR4P51571 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSR4P51571 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSR4P51571 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSR4P51571 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms