Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms