Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms