Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIP1P30622 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CLIP1P30622 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CLIP1P30622 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms